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ncrna介导的ephb4上调与低级别胶质瘤不良预后及肿瘤免疫浸润的相关性

Correlation of ncRNA - mediated Up - regulation of EphB4 with Poor Prognosis and Tumor Immunoinfiltration in Low - grade Glioma

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资源类型:

收录情况: ◇ 统计源期刊

机构: [1]首都医科大学宣武医院功能神经外科,北京100053 [2]国家儿童医学中心 首都医科大学附属北京儿童医院功能神经外科,100045
出处:

关键词: 低级别胶质瘤 促红细胞生成素生成人肝细胞受体B4 非编码RNA 免疫浸润 不良预后

摘要:
目的 探讨促红细胞生成素生成人肝细胞受体B4(erythropoietin-producing human hepatocellular receptors B4,EphB4)在低级别胶质瘤(lower-grade glioma, LGG)组织中的表达、其上游靶点以及与患者预后及肿瘤免疫浸润的相关性,分析其作为治疗靶点的潜在作用。方法 首先应用癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas, TCGA)数据库胶质瘤数据分析EphB4在胶质瘤与正常脑组织中的表达差异,并用基因表达谱交互分析(Gene Expression Profiling Interactive Analysis, GEPIA)数据库分析EphB4对不同癌症生存期的影响。用R语言和starBase数据库分析EphB4可能上游调节非编码RNA (non-coding RNA,ncRNA)。用肿瘤免疫评估资源(Tumor Immune Estimation Resource, TIMER)数据库进行EphB4表达与肿瘤免疫细胞浸润、免疫细胞生物学标志物和免疫检查点相关性分析。结果 UBA6-AS1/hsa-miR-346轴是最有潜力影响LGG中EphB4表达的上游ncRNA相关通路。同时,EphB4水平与LGG肿瘤免疫细胞浸润、免疫细胞生物学标志物、免疫检查点表达均呈显著正相关。结论 ncRNA介导的EphB4上调与LGG的不良预后和肿瘤免疫浸润相关。

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第一作者:
第一作者机构: [1]首都医科大学宣武医院功能神经外科,北京100053
通讯作者:
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