随着医改进程的不断深入,医院科研管理水平的高低已经成为公立医院可持续发展的重要因素,直接决定了医院的经济效益、社会效益和竞争力,对医院的生存和发展影响至关重要.实行预算绩效管理是医院科研经费管理探索的一次创新尝试.医院预算绩效管理是在预算管理中融入绩效理念,顺应了医院实行精细化管理的发展要求,从而提高预算支出效率、提升预算管理水平,是预算管理从规范性向效益性发展的必然要求.通过构建医院科研经费预算绩效管理系统,加强医院科研经费预算绩效管理,提高资源配置,为社会提供更多更好的医疗产品和服务,提高科研经费资金的经济性、效益性和效率性.本文首先对科研经费和预算绩效管理的相关概念进行了阐述,然后分析了实施医院科研经费预算绩效管理的必要性,以及绩效管理理念在医院科研经费预算管理中的应用,综合运用预算管理与绩效管理,实现二者有机融合,结合医院科研经费管理存在的问题,采用关键指标法(KPI),创建适用于医院预算管理全过程的绩效考评体系.