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文章类型：
机构：
[1]100050首都医科大学北京市神经外科研究所
研究所
北京市神经外科研究所
首都医科大学
首都医科大学附属天坛医院
[2]首都医科大学附属北京天坛医院神经外科神经电刺激研究与治疗北京市重点实验室
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诊疗科室
神经外科
神经外科
首都医科大学
首都医科大学附属北京天坛医院
首都医科大学附属天坛医院
出处：
ISSN：
关键词：
癫痫
大鼠
基因表达谱
长链非编码RNA
摘要：
目的 利用基因芯片筛选癫痫大鼠海马组织中差异表达的长链非编码RNA(lncRNAs)和mRNAs,分析lncRNAs在癫痫发病中的可能作用.方法 建立癫痫大鼠模型,提取海马RNA,利用Rat Gene 2.0 ST微阵列芯片分别检测5例癫痫及5例健康大鼠海马组织的lncRNAs和mRNAs表达,对差异表达的mRNAs进行GO、Pathway分析,构建lncRNAs和mRNAs的共表达网络,预测lncRNAs的可能功能.结果 按癫痫组与对照组的基因转录产物表达倍数大于1.2并且统计量P ＜0.05为标准筛选,得到差异lncRNAs 198个(上调92个,下调106个),差异表达mRNAs 1 804个(上调983个,下调821个).差异表达的mRNAs涉及离子转运、缺氧反应、细胞粘附、炎性反应等功能.Pathway分析显示,差异表达mRNAs在MAPK信号通路、局部粘附、p53信号通路、凋亡等方面功能的基因有显著地变化.生物信息学分析可初步预测差异lncRNAs可能的生物学功能及作用靶点.结论 本研究发现了癫痫大鼠海马组织中差异表达的lncRNAs和mRNAs,lncRNAs可能通过调控mRNAs的表达参与癫痫的发病或发展.
基金：
国家自然科学基金(81471315)%首都医科大学基础-临床科研合作基金(1140170045-14JL52)%北京市医院管理局重点医学专业发展计划,癫痫与功能神经外科(ZYLX201305)%北京市金桥工程种子资金
第一作者：
第一作者机构：
[1]100050首都医科大学北京市神经外科研究所
[2]首都医科大学附属北京天坛医院神经外科神经电刺激研究与治疗北京市重点实验室
推荐引用方式(GB/T 7714)：
韩春雷,孟凡刚,刘阳,等.癫痫大鼠海马组织长链非编码RNA差异表达的研究[J].中华神经外科杂志.2015,31(3):304-308.
