目的探讨低频限制性位点聚合酶链反应(infrequent-restriction-site PCR, IRS-PCR)在金黄色葡萄球菌(简称金葡菌)基因分型中的应用价值. 方法建立本实验室IRS-PCR方法.同时用IRS-PCR和脉冲场凝胶电泳(PFGE)对金葡菌进行基因分型.根据49株社区感染分离菌的分型结果计算辨别力指数(ID)值估计分辨力.对其中30株社区感染菌重复实验一次估计重复性.比较两种基因分型方法的分型率、分辨力、重复性、结果的一致率及操作特点. 结果建立IRS-PCR对金葡菌基因分型的方法.70株金葡菌均可被2种方法分型,分型率100%.IRS-PCR分为38个型,21株院内感染菌分为6个型,49株社区感染菌分为32个型,计算ID值为0.981.PFGE分为40个型,21株院内感染菌分为6个型,49株社区感染菌分为34个型,计算ID值为0.983.两种分型方法的重复性均为100%.对院内感染菌,两种方法分型的一致率为100%;对社区感染菌,两种方法分型的一致率为92%(45/49).与PFGE相比,IRS-PCR更简单、省时、易于操作、不需特殊昂贵仪器. 结论 IRS-PCR能对金葡菌简易快速可靠分型,适合检验科对临床标本的快速有效分型,是一种有价值的分子流行病学研究工具.