先天性心脏病( congenital heart disease, CHD)，是胎儿期心血管发育异常、发育障碍或出生后应该退化的组织未能退化所造成的心血管畸形，是控制心脏发育的基因产生突变以及这些基因在时间(发育阶段)和空间(组织特异性)调控表达异常引起的。CHD是人类最常见的出生缺陷疾病，是婴幼儿非感染性疾病中最主要的死亡原因[1]。据国外文献报道的数据显示，CHD的发病率为（5.4～16.1）/1000[2]，而国内文献报道的出生缺陷监测结果中，CHD的发病率为25.1/10000[3]。CHD可因心脏结构和血流动力学异常而导致身体运动耐力下降、脑发育延迟、肺动脉高压、心脏扩大、心功能衰竭、艾森曼格综合征、血栓栓塞、亚急性细菌性心内膜炎、心律失常以及死亡[4-6]。近年来，随着对心脏发育分子机制的研究进展，发现了一系列参与心脏发育转录调节、信号传导和形态发生的关键基因，随后遗传学分析证实多个基因参与了CHD的发病[7]。随着对人类全基因组测序的成功和分子遗传学技术的发展，遗传因素在CHD中的作用受到越来越多的重视。因此，识别遗传缺陷对CHD的防治具有重要的临床意义。本文从近年来的CHD分子遗传学机制方面，对染色体异常、单基因突变、基因拷贝数变异(copy number variation，CNV)以及重要的转录调控因子的研究进展综述如下。