摘要:
目的 分析阿尔茨海默病(AD)小鼠与野生型(WT)小鼠海马组织中环状RNA(circRNA)表达与N6-甲基腺苷(m6A)甲基化修饰水平,初步探究环状circRNA m6A甲基化修饰参与AD的机制.方法 通过RNA高通量测序(RNA-seq)筛选APPswe/PS1dE9(APP/PS1)双转基因AD模型小鼠(3只)与相匹配的野生型小鼠(3只)海马组织中差异表达的circRNAs,并对其来源基因进行基因本体论(GO)和京都基因和基因组百科全书(KEGG)富集分析,实时荧光定量PCR(qRT-PCR)验证测序结果.通过SRAMP网站预测差异表达的circRNAs潜在的m6A修饰位点,利用甲基化RNA免疫共沉淀-定量PCR(MeRIP-qPCR)对具备很高可信度的m6A修饰位点进行验证分析.结果 与对照组比较,APP/PS1组有21个显著差异表达的circRNAs,其中15个circRNAs上调,6个circRNAs下调.GO富集分析显示,差异表达circRNA的来源基因与突触结构和功能相关;KEGG富集分析显示,来源基因与Hippo通路、脂类代谢等通路有关.qRT-PCR结果显示circRNA表达趋势与测序结果一致.APP/PS1组mmu-Bai3_0007低于对照组(0.033±0.002比1.006±0.136,t=12.38,P<0.01),mmu-Bai3_0007 m6A 甲基化修饰水平也低于对照组(0.144±0.018 比 0.431±0.087,t=5.62,P<0.01).结论 Bai3circRNA m6A 甲基化修饰可能通过调控Bai3circRNA的表达来参与AD发病.