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72例住院小婴儿咳嗽患者鼻咽部菌群组成研究

The study on nasopharynx microbiome community characteristic in 72 young infants hospitalized with cough

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收录情况: ◇ 统计源期刊

机构: [1]国家儿童医学中心首都医科大学附属北京儿童医院北京市儿科研究所儿科学国家重点学科国家呼吸系统疾病临床医学研究中心教育部儿科重大疾病研究重点实验室儿童呼吸道感染性疾病研究北京市重点实验室北京100045 [2]深圳市微健康基因研究院微生物研究部广东深圳518129
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关键词: 小婴儿 百日咳 百日咳鲍特菌 呼吸道合胞病毒 菌群组成特征

摘要:
目的 探索小婴儿咳嗽患者鼻咽部菌群状况,以及百日咳鲍特菌感染等临床特征与菌群组成的关系.方法 以2015-2017年北京儿童医院新生儿中心收治的患有咳嗽的小婴儿为研究对象,包括百日咳鲍特菌培养确诊百日咳患者24例,以及按1∶2比例选择同期收治的有咳嗽症状但百日咳鲍特菌培养阴性著48例.收集患儿性别、年龄、分娩方式、喂养方式等临床资料,并对其进行呼吸道合胞病毒(RSV)及百日咳鲍特菌检测.提取患儿鼻咽拭子中基因组DNA,扩增16S rDNA的V3 ~ V4区并测序.结果 72例小婴儿咳嗽患者共鉴定出5种菌群分布谱型(C1 ~ C5).24例百日咳鲍特菌培养阳性病例标本有22例检到鲍特菌属的16S rDNA片段.48例鲍特菌培养阴性的病例标本有34例检出鲍特菌片段,丰度为0.003% ~0.280%.百日咳鲍特菌培养阳性组鲍特菌属平均相对丰度(28.38%)明显高于阴性组(0.03%).RSV阳性组鼻咽部标本中葡萄球菌属和鲍特菌属平均相对丰度显著低于RSV阴性组.结论 除以鲍特菌属为优势的谱型外,本组小婴儿咳嗽患者鼻咽部菌群分布的其他4种型与已知小婴儿期菌群构成相似.有些百日咳患儿可能因鲍特菌属丰度极低,培养方法难以发现.是否RSV感染与小婴儿咳嗽患者鼻咽部菌群组成特征明显相关.

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第一作者:
第一作者机构: [1]国家儿童医学中心首都医科大学附属北京儿童医院北京市儿科研究所儿科学国家重点学科国家呼吸系统疾病临床医学研究中心教育部儿科重大疾病研究重点实验室儿童呼吸道感染性疾病研究北京市重点实验室北京100045
通讯作者:
通讯机构: [1]国家儿童医学中心首都医科大学附属北京儿童医院北京市儿科研究所儿科学国家重点学科国家呼吸系统疾病临床医学研究中心教育部儿科重大疾病研究重点实验室儿童呼吸道感染性疾病研究北京市重点实验室北京100045
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