目的：比较不同医改政策下脑梗死患者住院费用的差别，为北京市医改政策的制定提供建议。方法根据相关理论，从倾向性、需求性和可及性3个方面，利用2012年首都医科大学附属北京天坛医院连续推行绩效考核、总额预付、医药分开3项医改政策前后脑梗死住院患者的相关数据，通过SPSS 18.0，进行秩和检验和多因素回归分析，并建立回归模型，最后通过运用回归模型，比较脑梗死患者在不同医改阶段住院费用的差别。结果在不同医改阶段，脑梗死患者住院费用出现了显著差异：较医疗改革前，绩效考核阶段医保患者负担下降11.44%，自费患者下降6.91%；绩效考核+总额预付阶段医保患者继续下降9.51%，自费患者上升2.88%；绩效考核+总额预付+医药分开阶段医保患者上升4.75%，自费患者下降25.50%。结论医疗管理部门应关注各项医药改革对脑梗死患者住院费用的不同影响，加强医疗机构监管，引导脑梗死患者合理医疗，从而降低脑梗死患者的疾病负担。