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聚合酶链反应-高分辨率熔解曲线技术在下呼吸道细菌鉴定中的应用

Application of polymerase chain reaction-high-resolution melt technology for bacterial identification in samples collected f rom lower respiratory tract

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收录情况: ◇ 统计源期刊

机构: [1]首都医科大学医学实验与测试中心北京100069 [2]济宁医学院药学院2013年级药物制剂技术日照276826 [3]首都医科大学附属友谊医院妇产科北京100050 [4]首都医科大学附属北京天坛医院急诊科北京100050
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关键词: 聚合酶链反应-高分辨率熔解曲线技术 微生物菌群 16S rDNA文库 慢性阻塞性肺病 哮喘

摘要:
为探讨聚合酶链反应‐高分辨率熔解曲线(PCR‐HRM)技术在检测呼吸道菌群中的应用,本研究用支气管镜从慢性阻塞性肺病患者下呼吸道采集分泌液,提取细菌总DNA ,以16S通用引物27F/1492R扩增16S rDNA全长,PCR产物经电泳、纯化后连接到pGEMT‐Easy载体上,构建16S rDNA克隆文库。然后以16S rDNA V3区通用引物338F/518R扩增克隆文库,V3区PCR‐HRM分析在罗氏LightCycler 480实时荧光定量PCR系统中进行,采用HRM基因扫描软件分析数据。根据不同 HRM图型,挑选克隆株测序并鉴定菌株。结果显示,PCR‐HRM技术可灵敏区分下呼吸道不同细菌16S rDNA V3区,根据 HRM图谱可极大减少克隆菌株测序样本,提示PCR‐HRM技术可作为一种快速、高通量、敏感、经济的菌群多样性检测方法。

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第一作者:
第一作者机构: [1]首都医科大学医学实验与测试中心北京100069 [3]首都医科大学附属友谊医院妇产科北京100050 [4]首都医科大学附属北京天坛医院急诊科北京100050
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