目的 了解2008-2010年流行于中国大陆的人肠道病毒71型(human enterovirus 71,HEV71)病毒和2008年安徽阜阳株的进化关系以及C4a进化分支病毒在中国大陆各省、区的传播和流行情况.方法 从GenBank上获得2008-2010年中国大陆各省份流行的具有完整VP1(≥891bp)或近似完整VP1(≥876 bp)基因的核苷酸序列信息的HEV71毒株序列,采用MEGA 5.0软件,构建种系发生树,分析2008-2010年流行于中国大陆各省、区的C4a HEV71病毒与安徽阜阳株间的分子流行病学关系.结果 中国大陆2008-2010年流行的HEV71分离株除了8株属于A型,一株属于进化分支C4b外,其他均为C4a；目前流行于中国大陆各省、区的C4a病毒与2008年安徽阜阳株同源性较高(96.5％～100％),其溯源可至1998年的C4b病毒.2008年的阜阳株所引发的传播链主要集中在广东、江苏、上海、湖南、山东等省市.结论 中国大陆2008-2010年流行的HEV71分离株以C4a进化分支病毒为绝对优势病毒,阜阳株传播链主要分布在中国南部和以安徽为中心的中原地区.