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MALDI-TOF MS自建数据库对丝状真菌临床分离株鉴定能力的评估

Evaluation of the MALDI-TOF MS in-house database in identification of clinical filamentous fungi isolates

文献详情

资源类型:

收录情况: ◇ 统计源期刊 ◇ CSCD-C

机构: [1]首都医科大学宣武医院检验科,北京 100053 [2]中国医学科学院北京协和医院检验科,北京 100730 [3]侵袭性真菌病机制研究与精准诊断北京市重点实验室,北京 10073
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ISSN:

关键词: MALDI-TOF MS 丝状真菌 自建数据库 鉴定

摘要:
目的 评估MALDI-TOF MS自建数据库对丝状真菌临床分离株的鉴定能力.方法 分子测序技术明确41株拟建库丝状真菌的种属信息.采用标准提取法分别对拟建库菌株幼稚菌落和成熟菌落进行MALDI TOF MS自建数据库处理;另采用236株丝状真菌临床分离株评估该自建数据库的鉴定能力.结果 41株建库丝状真菌分属于10属25种.自建数据库包含82张参考质谱图.采用MALDI-TOF MS自建数据库可将评估菌株种水平鉴定率由商业数据库的29.2%(69/236)提升至67.5% (159/236);将自建数据库与商业数据库联合后,评估菌株种水平鉴定率为76.3% (180/236),且无错误鉴定情况.与形态学方法相比,MALDI-TOF MS自建数据库对临床常见曲霉菌株的鉴定无优势,对于曲霉少见种和非曲霉丝状真菌,其种水平鉴定率为61.8% (34/55),显著优于形态学方法(16.4%,9/55).结论 MALDI-TOF MS自建数据库有助于提高实验室丝状真菌鉴定能力,在形态学方法鉴定困难的少见丝状真菌鉴定方面其作用更为显著.

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第一作者:
第一作者机构: [1]首都医科大学宣武医院检验科,北京 100053 [3]侵袭性真菌病机制研究与精准诊断北京市重点实验室,北京 10073
通讯作者:
通讯机构: [2]中国医学科学院北京协和医院检验科,北京 100730 [3]侵袭性真菌病机制研究与精准诊断北京市重点实验室,北京 10073
推荐引用方式(GB/T 7714):

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