目的 探究缺血性脑卒中患者外周生物时钟节律的变化，并分析这种改变与特定脑区功能性连接改变之间的相关性。方法 采用前瞻性病例对照设计，于2018年1月—2019年7月在中国康复研究中心神经康复科招募17例缺血性脑卒中患者为卒中患者组，并在社会上招募17名健康对照者为健康对照组。比较两组血清处理后U2OS细胞的外周脑和肌肉芳烃受体样蛋白1(Bmal1)日常振荡周期。同时，利用静息态功能磁共振成像（rs-fMRI）技术，以双侧下丘脑为种子点，比较两组间的脑功能连接变化。采用Spearman相关分析卒中患者生物时钟节律变化与脑功能连接改变之间的相关性。结果 卒中患者组外周Bmal1日常振荡周期[（24.33±0.42）h]长于健康对照组[（23.81±0.48）h]，差异有统计学意义（t=3.352,P=0.002）。在脑功能连接方面，卒中患者组展现出下丘脑至右侧距状回以及下丘脑至右侧罗兰氏岛盖的脑功能连接增强现象，并且这种脑功能连接的增强程度与Bmal1振荡周期的长度呈正相关（r=0.369,P=0.032;r=0.393,P=0.022）。结论 缺血性脑卒中患者的外周生物时钟节律发生了改变，并可能与特定脑功能区的功能连接变化有关。