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◇ 统计源期刊
文章类型:
机构:
[1]国家儿童医学中心首都医科大学附属北京儿童医院遗传与出生缺陷防治中心北京市儿科研究所出生缺陷遗传学研究北京市重点实验室儿科重大疾病研究教育部重点实验室
首都医科大学附属北京儿童医院
[2]首都医科大学宣武医院神经外科
神经科系统
神经外科
首都医科大学宣武医院
出处:
ISSN:
关键词:
孕期
表达谱
烟草暴露
胎盘
差异表达
富集分析
回归分析
摘要:
目的 扩展孕期烟草暴露对孕妇和胎儿造成影响的分子机制的认识。方法 首先系统检索NCBI GEO和EBI ArrayExpress数据库,挑选符合条件的吸烟和不吸烟2组孕妇胎盘组织的基因表达谱数据集。然后整合并校正了数据集间的差异,采用差异表达、功能注释、富集分析、回归分析等多种生物信息方法和模型研究烟草暴露对孕妇和胎儿的影响。结果 通过合并后的表达谱数据找到476条差异表达的基因(FDR<0.5,|log2FC|>0.3),其中上调的基因317条,下调的基因159条。随后通过KEGG、GO以及Reactome、MSigDb对显著差异表达的基因进行功能注释和富集分析,发现这些基因主要出现在细胞外结构组织(P=1.10×10-28)、细胞外基质组织(P=3.44×10-25)以及间充质发育(P=2.60×10-13)等通路上。进一步针对烟草暴露标志物研究,采用回归分析发现CDCA7L基因在校正了母亲年龄等混杂因素后,与母亲血清中的可的宁含量最相关(FDR=0.046)。结论 通过系统研究,探讨了孕妇和胎儿在烟草暴露环境中可能受到影响的通路,烟草暴露影响胎盘功能和胎儿生长的机制,对后续深入的分子机制研究提出思路。
基金:
国家重点研发计划项目(2016YFC1000306);北京市自然科学基金项目(5222007)
第一作者:
第一作者机构:
[1]国家儿童医学中心首都医科大学附属北京儿童医院遗传与出生缺陷防治中心北京市儿科研究所出生缺陷遗传学研究北京市重点实验室儿科重大疾病研究教育部重点实验室
通讯作者:
推荐引用方式(GB/T 7714):
刘玄石,郝婵娟,徐立新,等.基于胎盘基因表达谱研究孕期烟草暴露对孕妇和胎儿的影响[J].中华全科医学.2022,20(08):1346-1349+1383.