目的 通过对新生儿临床分离的大肠杆菌菌株进行分型以示大肠杆菌菌株间的异质性和亲缘性,了解大肠杆菌感染的分子流行病学特征.方法 对2009年9月至2012年5月间北京儿童医院新生儿中心住院的102例患儿的110株大肠杆菌进行脉冲场凝胶电泳分型(PFGE).结果 110株大肠杆菌临床分离株经PFGE共分65型,相似系数在47.3％～100％,条带在13 ～ 22条.优势基因型有13株,相似系数在80.4％～ 100％.有8对临床分离菌株分别来自于同一患儿,其中7对经PFGE分型方法证实它们属于同一型别(其中l对菌株来自于同一患儿的血液及脑脊液的标本,经PFGE分型证实属于同一基因型,相似系数为93.8％);另l对显示不是同一型别,亲缘关系较远,故从同源性分析来看不除外不同菌株感染或污染的可能.5株菌株经PFGE证实菌株间亲缘关系较近,其中1株分离株来源的患儿曾与4株分离株来源的患儿同住一病房,考虑为院内获得性感染.结论 PFGE分型方法准确、可靠,可以协助临床明确和区分致病株与非致病株,追踪传染源,对于院内感染的防控起到重要的作用.