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文章类型:
机构:
[1]中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所北京100050
[2]首都医科大学附属北京儿童医院
首都医科大学
首都医科大学附属北京儿童医院
出处:
ISSN:
关键词:
呼吸道合胞病毒
基因
序列分析
摘要:
目的 阐明人呼吸道合胞病毒(human respiratory syncytial virus,HRSV)A和B亚型病毒分离株的核蛋白(nucleoprotein,N)编码基因特征.方法 采用逆转录-聚合酶链反应(revelrse transciptionpolymerase chain reaction,RT-PCR)对北京2004年分离的HRSV代表株(2株A亚型和2株B亚型)进行N基因全长序列扩增、测序,并和GenBank下载的所有HRSV病毒的N基因全长序列进行对比和分析.结果 2株HRSV A亚型分离株与A亚型Long株(标准株)的N蛋白的核苷酸和氨基酸差异分别为36~40个(3.1%~3.4%)和4个(1.0%);2株HRSV B亚型分离株与B亚型CH18537株(标准株)的N蛋白之间的核苷酸和氨基酸差异分别为17(1.4%)和1(0.3%)个.4株HRSV代表株和从GenBank下载的HRSV的N蛋白之间的核苷酸和氨基酸差异分别为3~172个(0.25%~14.63%)和0-18个(0~4.6%).结论 N基因在HRSV基因组中是较为保守的基因,A或B亚型的型内差异相对较小;但A和B亚型之间N基因序列有较大变异,变异平均分配于整个N基因中;本研究为HRSV基因快速诊断试剂的研制提供了基因信息学数据.
第一作者:
第一作者机构:
[1]中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所北京100050
推荐引用方式(GB/T 7714):
张燕,王慧玲,谢正德,等.呼吸道合胞病毒分离株N蛋白编码基因特征分析[J].中华实验和临床病毒学杂志.2009,23(2):115-117.