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人呼吸道合胞病毒分离株基质蛋白基因特征分析

Genetic Characteristics of the Matrix Protein of Human Respiratory Syncytia Viruses

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收录情况: ◇ 统计源期刊

机构: [1]中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所病毒基因工程国家重点实验室北京100050 [2]首都医科大学附属北京儿童医院北京100045 [3]青海省疾病预防控制中心西宁810007
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关键词: 人呼吸道合胞病毒 基质蛋白基因 序列分析

摘要:
目的 阐明人呼吸道合胞病毒(Hufnan Respiratory Syncytial Virus,HRSV)A、B亚型病毒分离株的基质蛋白(Matrix Protein,M)编码基因特征.方法 采用逆转录-聚合酶链反应(Reverse Transciption-Polymerase ChainReaction,RT-PCR)对北京市2004年分离的HRSV代表株(A、B亚型各2株)进行M基因全长序列扩增,测序,并和基因库下载的所有HRSV的M基因全长序列进行对比和分析.结果 2株HRSV A亚型分离株与A亚型Long株(标准株)M基因之间的核苷酸和氨基酸差异,分别为24、26个(3.1%~3.4 0A)和1个(0.39%).2株HRSV B亚型分离株与B亚型参考株9320的M基因之间的核苷酸和氨基酸差异,分别为16、19个(2.1%、2.46%)和2、1个(0.78%、0.39%).所测定的北京市4株HRSV分离株和从基因库下载的M基因全序列之间的核苷酸和氨基酸差异,分别为24~119个(3.1%~15.4%)和1~21个(0.39%~8.2%).结论 M基因在HRSV基因组中是较为保守的基因之一,A或B亚型的型内差异相对较小;但A、B亚型之间有较大差异,变异平均分配于整个M基因中.M基因的这些基因特征使其可以作为A、B亚型基因检测分型诊断的候选靶基因.该研究为HRSV基因快速诊断试剂的研制提供了基因信息学数据.

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第一作者:
第一作者机构: [1]中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所病毒基因工程国家重点实验室北京100050
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