摘要:
目的 阐明人呼吸道合胞病毒(Hufnan Respiratory Syncytial Virus,HRSV)A、B亚型病毒分离株的基质蛋白(Matrix Protein,M)编码基因特征.方法 采用逆转录-聚合酶链反应(Reverse Transciption-Polymerase ChainReaction,RT-PCR)对北京市2004年分离的HRSV代表株(A、B亚型各2株)进行M基因全长序列扩增,测序,并和基因库下载的所有HRSV的M基因全长序列进行对比和分析.结果 2株HRSV A亚型分离株与A亚型Long株(标准株)M基因之间的核苷酸和氨基酸差异,分别为24、26个(3.1%~3.4 0A)和1个(0.39%).2株HRSV B亚型分离株与B亚型参考株9320的M基因之间的核苷酸和氨基酸差异,分别为16、19个(2.1%、2.46%)和2、1个(0.78%、0.39%).所测定的北京市4株HRSV分离株和从基因库下载的M基因全序列之间的核苷酸和氨基酸差异,分别为24~119个(3.1%~15.4%)和1~21个(0.39%~8.2%).结论 M基因在HRSV基因组中是较为保守的基因之一,A或B亚型的型内差异相对较小;但A、B亚型之间有较大差异,变异平均分配于整个M基因中.M基因的这些基因特征使其可以作为A、B亚型基因检测分型诊断的候选靶基因.该研究为HRSV基因快速诊断试剂的研制提供了基因信息学数据.