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胶质母细胞瘤中异常甲基化调控的蛋白编码基因识别研究

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资源类型:

收录情况: ◇ 统计源期刊 ◇ 北大核心

机构: [1]首都医科大学生物医学工程学院生物医学信息学系,北京100069 [2]首都医科大学宣武医院麻醉手术科,北京100053 [3]国家老年疾病临床研究中心,北京100053
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关键词: 胶质母细胞瘤 蛋白编码基因 DNA甲基化 调控 生物标志物

摘要:
目的通过整合多组学数据,识别胶质母细胞瘤(glioblastoma, GBM)中表达受DNA甲基化调控的蛋白编码基因(protein-coding genes,PCGs),评估不同甲基化模式下PCGs的生物学功能,挖掘与GBM预后相关的风险标志物。方法基于多组学数据,构建GBM中PCGs的DNA甲基化谱,筛选表达受异常甲基化调控的PCGs并进行功能富集分析。同时结合GBM临床数据,对筛选出的PCGs进行生存分析。结果识别出表达受异常甲基化调控的PCGs 630个,挖掘出51个与GBM预后相关的PCGs。结论系统识别GBM中潜在的表达受异常甲基化调控的PCGs,并对识别GBM风险标志物和潜在的治疗靶点提出了新的认识。

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第一作者:
第一作者机构: [1]首都医科大学生物医学工程学院生物医学信息学系,北京100069
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