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变性高效液相色谱分析巯嘌呤甲基转移酶基因多态性位点

Analysis of Thiopurine Methyltransferase Gene Polymorphism by Denaturing HPLC

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资源类型:

收录情况: ◇ 北大核心

机构: [1]首都医科大学附属北京儿童医院血液中心北京100045 [2]北京大学第一医院血液科北京100034
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关键词: 变性高效液相色谱分析 巯嘌呤甲基转移酶基因 多态性

摘要:
目的 应用变性高效液相色谱技术(DHPLC)分析巯嘌呤甲基转移酶(TPMT)基因多态性位点.方法 用以PCR为基础的DHPLC,检测健康成人和脐血以及急性白血病病人,TPMT基因第5外显子G238C、第7外显子G460A和第10外显子A719G的3个多态性位点.结果 健康成人、脐血和急性白血病病人全部DNA样本,TPMT基因外显子区的3个位点的多态性频率为3.49%,远低于白种人和非洲人.变异的位点仅为第10外显子A719G,且均为杂合变异.TPMT第5外显子630例标本的色谱峰均为单峰.第7外显子有316例为单峰,214(34%)为杂合峰.将单峰标本进行1:1混合后重新进样也有杂合峰出现.经DNA测序分析,证实此区无序列变异;杂合峰标本在54和60℃为单峰,55~59℃均为杂合峰.而单峰标本峰形未随温度发生变化.说明DHPLC的检测误差并不是柱箱温度不合适引起的.第10外显子有608例为单峰,杂合峰为22例,其中10/22例标本进行DNA直接测序,证实为杂合变异.结论 DHPLC技术能快速筛选出TPMT第5和第10外显子区的多态性位点,但不能检测出第7外显子的多态性位点.因此,DHPLC不能作为单一方法进行TPMT基因多态性位点的检测.

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第一作者:
第一作者机构: [1]首都医科大学附属北京儿童医院血液中心北京100045
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