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巯嘌呤甲基转移酶基因多态性分析方法探讨

Exploration of Methodology for Assay of Single Nucleotide Polymorphism in Thiopurine Methyltransferase Gene

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资源类型:
机构: [1]首都医科大学附属北京儿童医院血液中心100045 [2]北京大学第一医院血液科100034
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关键词: 巯嘌呤甲基转移酶 巯嘌呤甲基转移酶基因 单核苷酸多态性 基因多态性

摘要:
建立以PCR为基础的位点特异性PCR、限制性内切酶消化、变性高效液相色谱分析和SNaPshot定点的序列分析等方法,并结合DNA直接测序检测巯嘌呤甲基转移酶(TPMT)基因的5个单核苷酸多态性(SNP)位点的多态性频率.在实验过程中还探讨基因多态性检测的方法学,比较几种方法的可信度、可行性及其优劣.研究结果显示,限制性内切酶消化法能准确地检测TPMT基因外显子区的SNP,变性高效液相色谱分析技术能快速筛选出TPMT第5和第10外显子区的SNP,但不能检测出第7外显子的SNP;位点特异性PCR不能检测出TPMT基因外显子区的SNP, SNaPshot定点的序列分析检测TPMT基因外显子和启动子区的SNP准确率高.通过比较几种SNP检测方法后获得的结论是,TPMT基因SNP位点的检测应根据标本量和实验条件首选限制性酶切消化法、DNA测序或SNaPshot定点序列分析,有时一种技术不能完全满足检测的需要,必须几种方法的相互补充.

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第一作者:
第一作者机构: [1]首都医科大学附属北京儿童医院血液中心100045
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