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衰老细胞染色质开放变化的初步分析

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收录情况: ◇ 统计源期刊 ◇ CSCD-E

机构: [1]首都医科大学宣武医院检验科,中国北京100053
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ISSN:

关键词: 复制性衰老 ATAC-seq测序 转录调控 染色质开放程度

摘要:
为研究复制性衰老中表观遗传学的变化,以年轻代龄(PD26)和年老代龄(PD55)的人胚肺二倍体成纤维细胞(2BS)为材料,进行ATAC-seq测序,并使用Bowtie2、FastQC、MACS、deepTools、phastCons、R语言、HOMER以及基因本体论(Gene Ontology, GO)对测序结果进行深入分析和挖掘。结果显示, 2BS细胞染色质开放区域的保守性较强,其主要集中于启动子(promoter)区至转录起始位点(transcription start site, TSS),且年轻细胞与年老细胞的启动子区至转录起始位点的开放程度不同,细胞随着衰老在启动子区至转录起始位点的开放程度逐渐下降。进一步对年轻和年老细胞之间存在显著差异的靶基因进行GO分析发现,这些差异基因主要与细胞进程、代谢、生物性调节、结合功能、催化功能相关。本次研究发现衰老过程中染色质开放区减少、转录调控水平下降,提示复制性衰老与转录调控关系密切。

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中文影响因子:
第一作者:
第一作者机构: [1]首都医科大学宣武医院检验科,中国北京100053
通讯作者:
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