目的 调查迁延性咳嗽(咳嗽≥2周)的未免疫或未完全免疫婴幼儿博德特百日咳杆菌感染情况.方法 2011年1月1日至2012年12月31日,采用前瞻性研究方法对首都儿科研究所附属儿童医院就诊或收治的迁延性咳嗽(咳嗽≥2周)未免疫及未完成全程免疫患儿采集呼吸道分泌物及血清,分别采用多重PCR方法及酶联免疫吸附试验(ELISA)检测博德特百日咳杆菌及博德特百日咳杆菌毒素抗体,收集患儿的临床及流行病学资料.结果 入组患儿176例,百日咳博德特菌感染率29.0％ (51/176),百日咳多重PCR检测阳性51例,血清学检测阳性18例.51例百日咳患儿年龄23d～4岁,＜1岁者46例(90.2％),≥1岁者5例(9.8％)；男31例,女20例.＜1岁未接种百白破疫苗婴儿35例,其中＜3个月龄者31例,3 ～ 12个月龄4例；＜1岁未完成全程接种11例；≥1岁5例患儿均未接种.百日咳春夏季发病较多,秋冬发病较少.9例患儿有家庭内咳嗽患者接触史,与其接触的有慢性咳嗽家庭成员12例,检测百日咳血清抗体阳性12例,百日咳多重PCR阳性3例.百日咳重症、有合并症患儿15例(15/51,29.4％),合并症包括重症肺炎、呼吸衰竭、脑病,腹股沟斜疝嵌顿等.结论 博德特百日咳杆菌感染是未免疫或未获得完全免疫的婴幼儿迁延性咳嗽的重要致病因素之一；百日咳发病以春夏为多；百日咳感染婴儿病情重,合并症发生率高；未诊断的成人或年长儿百日咳可能是婴儿的重要传染源.百日咳杆菌多重PCR检测快速、敏感,可用于临床早期诊断.