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多位点数目可变串联重复序列分析在北京基因型结核分枝杆菌基因分型中的应用

Evaluation of multiple locus variable number tandem repeat analysis (15-locus set) in genotyping of Mycobacterium tuberculosis strains of the Beijing genotype

文献详情

资源类型:

收录情况: ◇ 统计源期刊 ◇ 北大核心 ◇ CSCD-C ◇ 中华系列

机构: [1]首都医科大学附属北京儿章医院100045 [2]北京胸科医院检验科 [3]俄罗斯圣彼得堡巴斯德研究所圣彼得堡197101 [4]100045首都医科大学附属北京儿章医院
出处:
ISSN:

关键词: 分枝杆菌 结核 小卫星重复 基因型 多态性 限制性片段长度

摘要:
目的 评价多位点MLVA的15位点组合在北京基因型结核分枝杆菌(MTB)基因分型研究中的应用价值.方法 采用MLVA(15位点)对来源于北京胸科医院的72株北京基因型MTB菌株进行基因分型,并将结果与金标准IS6110-RFLP的分型结果进行比较.结果 MLVA(15位点)分型后共得到59个类型,其中53个为独特类型,其总体分辨力为0.990,多态性较好的位点有Qub-11b、Mtub 21和QUB-26;IS6110-RFLP分型后共得到69个类型,其中66个为独特类型,分辨力高达0.999,并可对MLVA(15位点)中成簇的菌株进一步区分.结论 MLVA(15位点)在北京基因型菌株中具有较好的分辨能力,但成簇菌株仍需采用金标准IS6110-RFLP进一步细分.

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第一作者机构: [1]首都医科大学附属北京儿章医院100045
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