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变性高效液相色谱法筛选胶质瘤易感基因ERCC2的单核苷酸多态性

Screening single nucleotide polymorphisms in the predisposing gene-ERCC2 of gliomas by denaturing high-performance liquid chromatography

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资源类型:
机构: [1]北京市神经外科研究所北京100050 [2]天津市环湖医院神经外科 [3]北京天坛医院 [4]吉林大学附属一院神经外科 [5]哈尔滨医科大学附属二院神经外科 [6]北京大学医学部 [7]哈尔滨医科大学附属一院神经外科
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关键词: 变性高效液相色谱 单核苷酸多态性 胶质瘤 易感基因

摘要:
目的筛选和鉴定脑胶质瘤易感基因ERCC2--纠正鼠突变细胞切除修复缺陷基因的单核苷酸多态性(SNPs).方法应用参考文献所报道的引物序列,PCR扩增179例胶质瘤患者肿瘤及血液标本和44例正常对照组血液标本ERCC2基因第22外显子及其邻近的部分内含子序列,采用DHPLC技术对扩增片段进行基因变异检测,将不同类型的PCR片段进行全序列测序并与参考序列对比分析.结果在此片段中验证了一个已知的SNP位点,初步鉴定了1个新的SNP位点,排除了1个已知在白种人存在的SNP位点和基因型.结论SNPs位点存在人种间差异;DHPLC预测结合全序列测序是一种高效、经济、简便、可靠的SNP筛选方法.

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第一作者:
第一作者机构: [1]北京市神经外科研究所北京100050
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