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2种检测人偏肺病毒感染的荧光定量PCR方法的应用比较

Evaluation of Two Real-Time RT-PCR Assays for Optimal Detection of Human Metapneumovirus in Nasopharyngeal Aspirates from Children in Beijing, China

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收录情况: ◇ 统计源期刊

机构: [1]中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所国家卫计委医学病毒学与病毒病重点实验室北京102206 [2]首都医科大学附属北京儿童医院北京100045
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ISSN:

关键词: 人偏肺病毒 荧光定量PCR 检测 北京

摘要:
目的:比较基于人偏肺病毒(hMPV)N或L基因的2种检测hMPV感染的荧光定量PCR方法在207例临床呼吸道样本检测中的应用效果.方法:建立基于hMPVN或L基因片段的荧光定量PCR方法,检测2008年5月至2009年3月在北京儿童医院因急性呼吸道感染的住院患儿鼻咽拭子207份,比较2种方法检出率的敏感性和特异性.结果:在207份样本中,2种方法共检出38(18.36%)份阳性样本,基于N或L基因一种方法均检出32(15.46%)份阳性样本,总检出符合率为94.2% (195/207).另外发现,基于L基因检测为阴性而基于N基因检测为阳性的样本在L基因与引物和探针结合的部分序列有核苷酸的突变.对19例阳性样本的F基因进行进化树分析发现,大多数hMPV属于A2和B2型,只有l例属于B1型.结论:2种荧光定量PCR方法的联合应用,对于临床样本中hMPV的检测更为敏感.

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第一作者:
第一作者机构: [1]中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所国家卫计委医学病毒学与病毒病重点实验室北京102206
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